Este año empezó con la primera reunión del Consejo Comunitario (conformado por los miembros más comprometidos con la Comunidad) y la elección del segundo Coordinador General. Durante 1981, la crisis generada por la muerte de Héctor se acentuó, quedando apenas un puñado de comunos en la Casa, descontando al grupo "Desde la Vida", aún adolescentes. Estos últimos tuvieron su propia crisis que terminó en la división del grupo. Las Eucaristías dominicales fueron temporalmente suspendidas al haberse convertido para algunos en ocasión de mero encuentro social. A mediados de ese año, empezó a reaccionar la Comunidad, tomándose la decisión de redactarse los primeros Estatutos. En la tarea se pusieron a trabajar los cuatro grupos entonces existentes. Para entonces, la presencia de los representantes de los grupos en la Junta de Coordinadores resultó más eficaz que la de los Coordinadores de Área, haciéndose patente la crisis del antiguo modelo de organización.
El trabajo de catequesis de Confirmación iniciado en 1980 empezó a crecer hacia otros colegios y perfeccionarse. Ello a su vez facilitó la entrada de nuevos jóvenes a la Comunidad. El trabajo en sectores populares, por otro lado, se potenciaba con el ingreso a universidades de cada vez más "comunos". Por otro lado, ante la desaparición del grupo "Mundo Nuevo" y respondiendo a una provocadora carta anónima de uno de los menores, los mayores de la Comunidad (discípulos y compañeros de Héctor, que nunca habían tenido un grupo estable) decidieron agruparse por fin, fundando Siquem. Los otros grupos que funcionaron ese año fueron Desde la Vida I, Desde la Vida II y Antioquía, éste último formado por recoletanos provenientes de la Confirma.
